فيما ظل عمدة لندن برفقة العديد من الجنود داخل المدينة بهدف وقف انتشار المرض وحفظ الأمن، وبحلول حزيران/يونيو 1665 أغلق الأخير أبواب المدينة ورفض السماح لغير النبلاء بمغادرتها. كما جنّد مزيدا من الأشخاص لمراقبة المنازل التي وضع أفرادها بالحجر الصحي. رسم تخيلي لعملية نقل جثث ضحايا طاعون لندن عام 1665 مع التأكد من إصابة شخص ما بالطاعون، يحبس الأخير رفقة بقية أفراد عائلته بمنزله كما توضع علامة على الباب لتحديد المنزل. وبذلك، تنتقل العدوى لبقية أفراد العائلة ليفارق جميعهم الحياة خلال الفترة التالية. تحميل خلفيات لندن, ليلة, الشوارع القديمة, مقهى, أوروبا, إنجلترا, المملكة المتحدة لسطح المكتب مجانا. صور لسطح المكتب مجانا. أيضا، جابت عربات شوارع لندن وتكفلت بعملية جمع الجثث من المنازل بهدف نقلها بعيدا ووضعها بمقابر جماعية. خلال شهر كانون الأول/ديسمبر 1665، تراجع عدد الوفيات بشكل واضح ليبدأ بذلك العديد من النبلاء والأثرياء بالعودة. وبحلول شهر شباط/فبراير 1666، سمح للملك تشارلز الثاني ومرافقيه بالعودة للندن بعد أن تحدّث المسؤولون عن قرب زوال الوباء. أسفر طاعون لندن لعام 1665 عن وفاة أكثر من 100 ألف شخص وهو الرقم الذي يعادل حسب أغلب الإحصائيات ربع سكان المدينة. لاحقا، عرفت لندن خلال شهر أيلول/سبتمبر 1666 كارثة ثانية تمثّلت في "حريق لندن العظيم" حيث احترقت أجزاء واسعة من العاصمة ليجد بذلك عشرات آلاف الأشخاص أنفسهم دون مأوى.
صورة لملك إنجلترا تشارلز الثاني بادئ الأمر، انتشر المرض بشكل بطيء في لندن، وبحلول شهر أيار/مايو 1665، سجلت العاصمة الإنجليزية 43 حالة وفاة وخلال الشهر التالي بلغ إجمالي الوفيات بسبب الطاعون 6137 حالة، أما شهر تموز/يوليو من نفس السنة فقد شهد 17036 وفاة لكن خلال شهر آب/أغسطس بلغ عدد ضحايا الطاعون بلندن رقما قياسيا فاستقر في حدود 32 ألف وفاة. وعلى حسب الإحصائيات، فارق 15 بالمئة من سكان لندن الحياة بسبب الطاعون خلال صيف عام 1665. وسجّل الطاعون انتشاره بكثافة بالأحياء الفقيرة للندن التي عانت من إجراءات صحية رديئة، وبسبب ارتفاع أجرة الأطباء، فارق كثيرون الحياة في ظروف صعبة وافتقروا لأبسط الخدمات الطبية. أيضا، كان الأطباء عاجزين عن معالجة المرض بسبب عجزهم عن تحديد أسبابه واعتمادهم على طرق تقليدية كالفصد لعلاج المصابين. خلفيات شوارع لندن دبي. رسم تخيلي يجسد إحدى طرق العلاج بالفصد قديماً إلى ذلك، غادر الملك تشارلز الثاني رفقة مساعديه وأعضاء البرلمان لندن وفضّلوا الانتقال نحو أوكسفورد لتجنب الإصابة بالعدوى. أيضا، رحل الأثرياء والتجار وأغلب الأطباء عن المدينة ليظل الفقراء فقط محبوسين داخل أسوارها بعد أن منعوا من مغادرتها.