و بدوره ينتقل النيتروجين إلى المستهلكات عبر السلسلة الغذائية حيث يتكون البروتين الحيواني. و بعد موت النباتات و المستهلكات ، تقوم المحللات من بكتيريا و فطريات بتحليل البروتين النباتي أو الحيواني و إطلاق الأمونيا ( قد تصعد إلى الجو) أو أيونات الأمونيوم التي يمكن أن ينتج منها أيونات النترات وتصبح بدورها مصدرا جديدا للنيتروجين في التربة تمتصه النباتات التي تعيش فيها. و لا تعتبر النباتات و الحيوانات الميتة المصدر الوحيد لإثراء التربة بالنيتروجين ، بل يضاف لذلك أوراق النباتات و أزهارها و ثمارها المتساقطة ، و من الحيوانات شعرها المتساقط و ريشها و جلدها و هيكلها الخارجي بالإضافة إلى إفرازاتها الصلبة ( برازها) و إفرازاتها السائلة ( البول) المحتوية على مركبات نيتروجينية. دوره النيتروجين في الطبيعه الصامته. و تصبح التربة خصبة من تحلل هذه المركبات العضوية الغنية بالنيتروجين. مرحلة النترجة بعد أن تتشكل الأمونيا التي يمكن لبعض الطحالب والنباتات والكائنات أن تستخدمها ، وتقوم البكتيريا المعروفة باسم: البكتيريا المسببة للنترجة بتحويل الأمونيا إلى نترات. (-NO3-). تصفّح المقالات
دورة النيتروجين في النبات يعد النيتروجين العنصر الرئيسي في تكوين البروتين في النبات حيث يقوم النبات بإمتصاص النيتروجين على هيئة أنيون النترات وصيغته الكيميائية "NO3" من محلول الترةب وكاتيون الأمونيوم وصيغته الكيميائية "NH4+" من وضعية التبادل الإمتصاصي. مراحل دورة النيتروجين - ويكي ان. وعلى الرغم من ذلك فإن النبات لا يعتمد على تلك الصيغ مباشرة، حيث بعد إمتصاص النبات لها تدخل في عملية من التحولات المعقدة لتدخل في تركيب المركبات العضوية النيتروجينية والأحماض النيتروجينية والبروتين. يتم إختزال النترات إنزيمياً بالتدريج إلى أمونيا كما يلي: HNO3 > HNO2 > HNO)2 > NH2OH > NH3 > Amino Acids Protein وأسماء تلك العناصر بالترتيب: النترات < نيتريت < هايبونيتريت < هاديروكسيل امين < أمونيا < بروتين أحماض امينية ليحدث تكون الأمونيا من خلال إختزال النترات داخل النبات وإرتباطها بالأحماض العضوية لتتكون أحماض أمينية أولية. وتلك الأحماض هي المركبات الأولية الرئيسية لتكوين البروتين. وبناء على ذلك فإن مستوى النيتروجين المتوفر يحدد فعالية ونطاق تكون البروتين والمركبات النيتروجينية العضوية الأخرى التي تشمل الإنزيمات والأحماض النووية والكلوروفيل والفيتامينات.
تختزل النترات داخل النبات بقدر ما تستخدم الأمونيا في إنتاج المركبات العضوية النيتروجينيه به. وعلى الرغم ان النترات غير مضره للنبات إلا أن إرتفاع مستوياتها في انسجة النبات وتراكمها في المنتجات الزراعية مثل الخضروات والفواكة ينعكس بشكل سلبي على صحة الإنسان وجودة تلك المنتجات. حيث أنه في حاله إزدياد تركيز الأمونيا يحدث تسمم أموني للنبات.
يتعرض النيتروجين العضوي والمعدني المضاف إلى التربة على هيئة أسمدة معدنية إلى مهاجمة الكائنات الحية الدقيقة في التربة بحثاً عن الطاقة أو لإستهلاكه ليتحول النيتروجين العضوي إلى مركبات امينية ومن ثم امونيوم. "النشدرة" بعد ذلك يتحول الأمونيوم إلى نترات مروراً بمرحلة تكوين النتريت "النترجة" حيث يتم إمتصاص الأمونيوم والنترات من قبل النبات لتتحول إلى أشكال عضوية مختلفة من بروتينات وأحماض أمينية لتعود تلك المركبات إلى التربة على شكل بقايا محاصيل أو بقايا تغذية حيوانية "الأسمدة البلدية" أو أسمدة خضراء. دورة النيتروجين في التربة والنبات - روزبيديا. شكل دورة النيتروجين دورة النيتروجين في التربة بينما تقوم الكائنات الدقيقة في التربة بإستهلاك النيتروجين المعدني في بناء أجسامها ثم تعود تلك المركبات إلى التربة بعد نفوق تلك الكائنات لتتحلل من جديد وتدخل في دورة النيتروجين. تحدث عملية تحلل المادة العضوية خلال سلسلة من التفاعلات، وهي: 1. مرحلة التحول إلى مركبات أمينية مركبات أمينية + ثاني أكسيد كربون + طاقة – المادة العضوية تهاجم الكائنات الحية الرمية المادة العضوية لتتحول من مركبات نيتروجينية معقدة إلى مركبات أمينية أقل تعقيداَ سماعدة عمليات الهضم الإنزيمية، بجانب إنتاج الطاقة وغاز ثاني أكسيد الكربون.