من بين الهيئات الرئيسية لمنظمة المؤتمر الإسلامي: القمة الإسلامية ، ومجلس وزراء الخارجية ، والأمانة العامة ، بالإضافة إلى لجنة القدس وثلاث لجان دائمة معنية بالعلوم والتكنولوجيا والاقتصاد والتجارة والمعلومات والثقافة. هناك أيضًا هيئات متخصصة تحت راية منظمة المؤتمر الإسلامي بما في ذلك البنك الإسلامي للتنمية والمنظمة الإسلامية للتربية والعلوم والثقافة ، فضلاً عن الهيئات الفرعية والتابعة التي تلعب دوراً حيوياً في تعزيز التعاون في مختلف المجالات بين الدول الأعضاء في منظمة المؤتمر الإسلامي.
تعتبر منظمة المؤتمر الإسلامي ثاني أكبر منظمة حكومية دولية بعد الأمم المتحدة، وتضم في عضويتها سبعا وخمسين (57) دولة عضوا موزعة على أربع قارات. وتعتبر المنظمة الصوت الجماعي للعالم الإسلامي وتسعى لصون مصالحه والتعبير عنها تعزيزا للسلم والتناغم الدوليين بين مختلف شعوب العالم. وقد أنشئت المنظمة بقرار صادر عن القمة التاريخية التي عقدت في الرباط بالمملكة المغربية يوم 12 رجب 1398 هجرية (الموافق 25 سبتمبر 1969) ردا على جريمة إحراق المسجد الأقصى في القدس المحتلة. عقد في عام 1970 أول مؤتمر إسلامي لوزراء الخارجية في جدة وقرر إنشاء أمانة عامة يكون مقرها في جدة ويرأسها أمين عام للمنظمة. ويعتبر البروفسور أكمل الدين إحسان أوغلى تاسع أمين عام، وقد تولى هذا المنصب في يناير 2005 بعد أن انتخبه المؤتمر الإسلامي لوزراء الخارجية في دورته الحادية والثلاثين. اعتمد الميثاق الحالي لمنظمة المؤتمر الإسلامي في القمة الإسلامية الحادية عشرة التي عقدت في دكار يومي 13 و14 مارس 2008. وقد حدد الميثاق الجديد أهداف المنظمة ومبادئها وغاياتها الأساسية المتمثلة في تعزيز التضامن والتعاون فيما بين الدول الأعضاء. وعلى مدى السنوات الأربعين الماضية، ارتفع عدد الأعضاء من خمس وعشرين دولة، وهو عدد الأعضاء المؤسسين، ليبلغ سبعا وخمسين دولة عضوا.
الدورة السادسة انعقدت في مقديشو 22 شعبان 1384هـ إلى 29 شعبان 1384، 26 كانون أول 1964 م - إلى 2 كانون الثاني 1965. الدورة السابعة انعقدت في عمّان 1967 الدورة الثامنة. الدورة التاسعة انعقدت في كراتشي 13 شعبان 1408 هـ الموافق 1988 الدورة العاشرة انعقدت في كولمبو 1992. المجلس التنفيذي [ عدل] الرئيس: عبد الله بن عمر نصيف - السعودية. [3] نائب الرئيس: عبد الرحمن سوار الذهب - السودان. عضو المجلس التنفيذي: راجا ظفر الحق. عضو المجلس التنفيذي: حامد بن أحمد الرفاعي عضو المجلس التنفيذي: محمد حنيفة - سريلانكا عضو المجلس التنفيذي: عبد الله بن عبد المحسن التركي عضو المجلس التنفيذي: عبد الله بن صالح بن حميد. عضو المجلس التنفيذي: محمد عبده يماني. عضو المجلس التنفيذي: عبد الله بن بيه. عضو المجلس التنفيذي: الحبيب ابن الخوجه. عضو المجلس التنفيذي: علي الهاشمي. عضو المجلس التنفيذي: حسين حامد حسان. عضو المجلس التنفيذي: صالح أوزجان. عضو المجلس التنفيذي: أحمد كاظم الراوي. عضو المجلس التنفيذي: هاشم المجددي. عضو المجلس التنفيذي: صالح مهدي السامرائي. عضو المجلس التنفيذي: سعيد حارب. عضو المجلس التنفيذي: عمر بن عبد الله بن عمر نصيف عضو المجلس التنفيذي: عبد الله الدباغ.